バイオとインフォと

バイオとインフォで食べていきたい研究員の技術ブログ

CRISPRで作製した遺伝子ノックアウト株のgenotypingをSanger sequencingで行うための解析ツール

概要 CRISPRによるgene knockout (KO) 株のgenotypingをSanger sequencingで行うためのデータ解析ツールを紹介します。

Numpyroを使った常微分方程式のパラメータ推定 - Lotka-Volterra方程式

概要 Numpyroで微分方程式のパラメータ推定をやってみました。コードは前回のNumPuroデビュー記事のコードと同じrepositoryにあります。 github.com

NumPyroでMCMC - ロジスティックモデルを使った個体数増加のモデリング

概要 前から気になっていたNumpyroを試してみたので覚書。コードは以下のrepositoryにあります。 github.com

Docker+JupyterHubを使ったハンズオンセミナー用環境構築

概要 昔、身内数名でのハンズオンセミナー用にDocker+JupyterHubで環境構築をした話です。コードはここです↓ github.com