2023-12-10 CRISPRで作製した遺伝子ノックアウト株のgenotypingをSanger sequencingで行うための解析ツール 概要 CRISPRによるgene knockout (KO) 株のgenotypingをSanger sequencingで行うためのデータ解析ツールを紹介します。 続きを読む
2023-02-05 Numpyroを使った常微分方程式のパラメータ推定 - Lotka-Volterra方程式 概要 Numpyroで微分方程式のパラメータ推定をやってみました。コードは前回のNumPuroデビュー記事のコードと同じrepositoryにあります。 github.com 続きを読む
2023-01-28 NumPyroでMCMC - ロジスティックモデルを使った個体数増加のモデリング 概要 前から気になっていたNumpyroを試してみたので覚書。コードは以下のrepositoryにあります。 github.com 続きを読む
2022-12-20 Docker+JupyterHubを使ったハンズオンセミナー用環境構築 概要 昔、身内数名でのハンズオンセミナー用にDocker+JupyterHubで環境構築をした話です。コードはここです↓ github.com 続きを読む
